Az Intézet egy speciálisan kifejlesztett pedagógiai módszertannal tanítja a diákjait, melynek alapja az angol nyelv magas szintű szakmai ismerete (a későbbi globális sikerekhez), interdiszciplináris modulrendszeren keresztül megismerni és megérteni egy-egy tudományterület komplexitását és az átfedéseket másik területkre, valmint a személyre szabott oktatás, melynek alapja a mentorálás. Tapasztalatunk szerint a sikeres tanulmányi előmenetel elősegítésének leghatékonyabb módja a személyes beszélgetéseken alapuló oktatás, amely maximálisan figyelembe veszi az egyes diákok lehetőségeit és szükségleteit. Ezért van az, hogy a Milestone Intézet a diákjai felkészítésében a mentorálás módszerét alkalmazza, amelynek keretében minden diákkal „saját” tanár foglalkozik, aki segít neki, hogy tudása legjavát produkálja a felvételi során. Az Intéezt mentorok és szakoktatók (szeminárium vezetők) segítik a diákokat a tudományos fejlődésben. A mentor a Milestone Intézet valamennyi programjában a diák legfőbb és állandó társa, aki arra ösztökéli őt, hogy legyen törekvő és bátor a választásaiban; a mentor külön-külön foglalkozik a rábízott diákokkal, s felel tanulmányi előremenetelükért, segít nekik leküzdeni az esetleges akadályokat, a tanulmányiakban épp úgy, mint a személyes jellegű problémákat. A mentor dolga, hogy végigkísérje a diákot a sikerhez vezető úton, és segítse az előrehaladásban. A szakoktatók egy-egy terület szakmai kiválóságai, akik szemináriumokon és műhelyfoglalkozásokon tanítják a növendékeket. A világ legjobb egyetemeiről kerültek a Milestone Intézet csapatába. Tudásukat és tapasztalatukat adják át a diákoknak, segítve őket, hogy már a felvételi felkészülés folyamatában egyetemi szintű alapozást kapjanak tárgyaikban. A Milestone Intézet számos szervezettel is együttműködik (és folyamatosan keresi a kapcsolatok fejlesztésének lehetőségeit), hogy gyakornoki helyeket biztosítson diákjai számára. Emellett egyes diákok maguk gondoskodnak gyakornoki foglalkoztatási lehetőségeikről. Mindezen erőfeszítéseknek köszönhetően diákjaink több mint száz szervezetnél töltöttek rövidebb-hosszabb időt gyakornoki munkával, köztük olyan tekintélyes intézményeknél, mint az Amnesty International, UNICEF, Krétakör színházi társulat, Magyar Természettudományi Múzeum, AGB Productions televíziós műsorgyártó cég, Richter Gedeon multinacionális gyógyszervállalat, Századvég agytröszt, K-Monitor Korrupciófigyelő Iroda, Népszabadság, Heti Világgazdaság, HVG, BBC, Szépművészeti Múzeum, Kiscelli Múzeum, Szent László Kórház, KÉK Kortárs Épitészeti Központ. MKB Bank, Lufthansa Group, Külügyminisztérium, Cseperedő autizmus alapítvány, ELTE Pedagógiai Pszichológia Kar